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Shuffle核心概念、Shuffle调优及故障排除

2021-03-23 14:42
园陌
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Spark调优之Shuffle调优

本节开始先讲解Shuffle核心概念;然后针对HashShuffle、SortShuffle进行调优;接下来对map端、reduce端调优;再针对Spark中的数据倾斜问题进行剖析及调优;最后是Spark运行过程中的故障排除。

一、Shuffle的核心概念

1. ShuffleMapStage与ResultStage

ShuffleMapStage与ResultStage

在划分stage时,最后一个stage称为FinalStage,它本质上是一个ResultStage对象,前面的所有stage被称为ShuffleMapStage。

ShuffleMapStage的结束伴随着shuffle文件的写磁盘。

ResultStage基本上对应代码中的action算子,即将一个函数应用在RDD的各个partition的数据集上,意味着一个job的运行结束。

2. Shuffle中的任务个数

我们知道,Spark Shuffle分为map阶段和reduce阶段,或者称之为ShuffleRead阶段和ShuffleWrite阶段,那么对于一次Shuffle,map过程和reduce过程都会由若干个task来执行,那么map task和reduce task的数量是如何确定的呢?

假设Spark任务从HDFS中读取数据,那么初始RDD分区个数由该文件的split个数决定,也就是一个split对应生成的RDD的一个partition,我们假设初始partition个数为N。

初始RDD经过一系列算子计算后(假设没有执行repartition和coalesce算子进行重分区,则分区个数不变,仍为N,如果经过重分区算子,那么分区个数变为M),我们假设分区个数不变,当执行到Shuffle操作时,map端的task个数和partition个数一致,即map task为N个。

reduce端的stage默认取spark.default.parallelism这个配置项的值作为分区数,如果没有配置,则以map端的最后一个RDD的分区数作为其分区数(也就是N),那么分区数就决定了reduce端的task的个数。

3. reduce端数据的读取

根据stage的划分我们知道,map端task和reduce端task不在相同的stage中,map task位于ShuffleMapStage,reduce task位于ResultStage,map task会先执行,那么后执行的reduce task如何知道从哪里去拉取map task落盘后的数据呢?

reduce端的数据拉取过程如下:

map task 执行完毕后会将计算状态以及磁盘小文件位置等信息封装到MapStatus对象中,然后由本进程中的MapOutPutTrackerWorker对象将mapStatus对象发送给Driver进程的MapOutPutTrackerMaster对象;在reduce task开始执行之前会先让本进程中的MapOutputTrackerWorker向Driver进程中的MapoutPutTrakcerMaster发动请求,请求磁盘小文件位置信息;当所有的Map task执行完毕后,Driver进程中的MapOutPutTrackerMaster就掌握了所有的磁盘小文件的位置信息。此时MapOutPutTrackerMaster会告诉MapOutPutTrackerWorker磁盘小文件的位置信息;完成之前的操作之后,由BlockTransforService去Executor0所在的节点拉数据,默认会启动五个子线程。每次拉取的数据量不能超过48M(reduce task每次最多拉取48M数据,将拉来的数据存储到Executor内存的20%内存中)。

二、HashShuffle解析

以下的讨论都假设每个Executor有1个cpu core。

1. 未经优化的HashShuffleManager

shuffle write阶段,主要就是在一个stage结束计算之后,为了下一个stage可以执行shuffle类的算子(比如reduceByKey),而将每个task处理的数据按key进行“划分”。所谓“划分”,就是对相同的key执行hash算法,从而将相同key都写入同一个磁盘文件中,而每一个磁盘文件都只属于下游stage的一个task。在将数据写入磁盘之前,会先将数据写入内存缓冲中,当内存缓冲填满之后,才会溢写到磁盘文件中去。

下一个stage的task有多少个,当前stage的每个task就要创建多少份磁盘文件。比如下一个stage总共有100个task,那么当前stage的每个task都要创建100份磁盘文件。如果当前stage有50个task,总共有10个Executor,每个Executor执行5个task,那么每个Executor上总共就要创建500个磁盘文件,所有Executor上会创建5000个磁盘文件。由此可见,未经优化的shuffle write操作所产生的磁盘文件的数量是极其惊人的。

shuffle read阶段,通常就是一个stage刚开始时要做的事情。此时该stage的每一个task就需要将上一个stage的计算结果中的所有相同key,从各个节点上通过网络都拉取到自己所在的节点上,然后进行key的聚合或连接等操作。由于shuffle write的过程中,map task给下游stage的每个reduce task都创建了一个磁盘文件,因此shuffle read的过程中,每个reduce task只要从上游stage的所有map task所在节点上,拉取属于自己的那一个磁盘文件即可。

shuffle read的拉取过程是一边拉取一边进行聚合的。每个shuffle read task都会有一个自己的buffer缓冲,每次都只能拉取与buffer缓冲相同大小的数据,然后通过内存中的一个Map进行聚合等操作。聚合完一批数据后,再拉取下一批数据,并放到buffer缓冲中进行聚合操作。以此类推,直到最后将所有数据到拉取完,并得到最终的结果。

未优化的HashShuffleManager工作原理如下图所示:

未优化的HashShuffleManager工作原理2. 优化后的HashShuffleManager

为了优化HashShuffleManager我们可以设置一个参数:spark.shuffle.consolidateFiles,该参数默认值为false,将其设置为true即可开启优化机制,通常来说,如果我们使用HashShuffleManager,那么都建议开启这个选项。

开启consolidate机制之后,在shuffle write过程中,task就不是为下游stage的每个task创建一个磁盘文件了,此时会出现shuffleFileGroup的概念,每个shuffleFileGroup会对应一批磁盘文件,磁盘文件的数量与下游stage的task数量是相同的。一个Executor上有多少个cpu core,就可以并行执行多少个task。而第一批并行执行的每个task都会创建一个shuffleFileGroup,并将数据写入对应的磁盘文件内。

当Executor的cpu core执行完一批task,接着执行下一批task时,下一批task就会复用之前已有的shuffleFileGroup,包括其中的磁盘文件,也就是说,此时task会将数据写入已有的磁盘文件中,而不会写入新的磁盘文件中。因此,consolidate机制允许不同的task复用同一批磁盘文件,这样就可以有效将多个task的磁盘文件进行一定程度上的合并,从而大幅度减少磁盘文件的数量,进而提升shuffle write的性能。

假设第二个stage有100个task,第一个stage有50个task,总共还是有10个Executor(Executor CPU个数为1),每个Executor执行5个task。那么原本使用未经优化的HashShuffleManager时,每个Executor会产生500个磁盘文件,所有Executor会产生5000个磁盘文件的。但是此时经过优化之后,每个Executor创建的磁盘文件的数量的计算公式为:cpu core的数量 * 下一个stage的task数量,也就是说,每个Executor此时只会创建100个磁盘文件,所有Executor只会创建1000个磁盘文件。

优化后的HashShuffleManager工作原理如下图所示:

优化后的HashShuffleManager工作原理

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